Browsing by Subject "CD8"

Sort by: Order: Results:

Now showing items 1-3 of 3
  • Valori, Miko; Jansson, Lilja; Kiviharju, Anna; Ellonen, Pekka; Rajala, Hanna; Awad, Shady; Mustjoki, Satu; Tienari, Pentti J. l (2017)
    Somatic mutations have a central role in cancer but their role in other diseases such as autoimmune disorders is poorly understood. Earlier work has provided indirect evidence of rare somatic mutations in autoreactive T-lymphocytes in multiple sclerosis (MS) patients but such mutations have not been identified thus far. We analysed somatic mutations in blood in 16 patients with relapsing MS and 4 with other neurological autoimmune disease. To facilitate the detection of somatic mutations CD4 +, CD8 +, CD19 + and CD4-/CD8-/CD19- cell subpopulations were separated. We performed next-generation DNA sequencing targeting 986 immune related genes. Somatic mutations were called by comparing the sequence data of each cell subpopulation to other subpopulations of the same patient and validated by amplicon sequencing. We found non-synonymous somatic mutations in 12 (60%) patients (10 MS, 1 myasthenia gravis, 1 narcolepsy). There were 27 mutations, all different and mostly novel (67%). They were discovered at subpopulation-wise allelic fractions of 0.2%-4.6% (median 0.95%). Multiple mutations were found in 8 patients. The mutations were enriched in CD8 + cells (85% of mutations). In follow-up after a median time of 2.3 years, 96% of the mutations were still detectable. These results unravel a novel class of persistent somatic mutations, many of which were in genes that may play a role in autoimmunity (ATM, BTK, CD46, CD180, CLIP2, HMMR, IKEF3, ITGB3, KIR3DL2, MAPK10, CD56/NCAM1, RBM6, RORA, RPM and STAT3). Whether some of this class of mutations plays a role in disease is currently unclear, but these results define an interesting hitherto unknown research target for future studies. (C) 2016 The Authors. Published by Elsevier Inc.
  • Zhang, Kaiyi; Tao, Cong; Xu, Jianping; Ruan, Jinxue; Xia, Jihan; Zhu, Wenjuan; Xin, Leilei; Ye, Huaqiong; Xie, Ning; Xia, Boce; Li, Chenxiao; Wu, Tianwen; Wang, Yanfang; Schroyen, Martine; Xiao, Xinhua; Fan, Jiangao; Yang, Shulin (2021)
    Anti-inflammatory therapies have the potential to become an effective treatment for obesity-related diseases. However, the huge gap of immune system between human and rodent leads to limitations of drug discovery. This work aims at constructing a transgenic pig model with higher risk of metabolic diseases and outlining the immune responses at the early stage of metaflammation by transcriptomic strategy. We used CRISPR/Cas9 techniques to targeted knock-in three humanized disease risk genes, GIPR(dn) , hIAPP and PNPLA3(I148M) . Transgenic effect increased the risk of metabolic disorders. Triple-transgenic pigs with short-term diet intervention showed early symptoms of type 2 diabetes, including glucose intolerance, pancreatic lipid infiltration, islet hypertrophy, hepatic lobular inflammation and adipose tissue inflammation. Molecular pathways related to CD8(+) T cell function were significantly activated in the liver and visceral adipose samples from triple-transgenic pigs, including antigen processing and presentation, T-cell receptor signaling, co-stimulation, cytotoxicity, and cytokine and chemokine secretion. The similar pro-inflammatory signaling in liver and visceral adipose tissue indicated that there might be a potential immune crosstalk between the two tissues. Moreover, genes that functionally related to liver antioxidant activity, mitochondrial function and extracellular matrix showed distinct expression between the two groups, indicating metabolic stress in transgenic pigs' liver samples. We confirmed that triple-transgenic pigs had high coincidence with human metabolic diseases, especially in the scope of inflammatory signaling at early stage metaflammation. Taken together, this study provides a valuable large animal model for the clinical study of metaflammation and metabolic diseases.
  • Viisanen, Leevi (Helsingin yliopisto, 2019)
    Tutkimuksen tarkoituksena oli kartoittaa gastrointestinaaliseen stroomakasvaimeen (GIST) tunkeutuvien immuunijärjestelmän solujen määrä T-lymfosyyttien, tappaja-T- lymfosyyttien, säätelijä-T-lymfosyyttien, B-lymfosyyttien, luonnollisten tappajasolujen ja makrofagien osalta. Tutkimuksen materiaali koostui kasvainnäytteistä, jotka oli kerätty Scandinavian Sarcoma Group (SSG) lääketutkimus XVIII:n yhteydessä. Kasvainnäytteet värjättiin immunohistokemiallisin menetelmin kunkin immuunijärjestelmän solutyypin osalta yleisesti hyväksi todennetuilla vasta-aineilla (CD3, CD8, FOXP3, CD20, NCR1, CD48). Kasvainnäytteet värjättiin myös KIT-vasta-aineella, joka on yleisesti hyväksytty vasta-aine GIST:n diagnostiikassa. Värjäyksen jälkeen kasvainnäytteet kuvattiin automaattisella mikroskoopilla. Tämän jälkeen kasvaimeen tunkeutuvien solujen määrä laskettiin tietokoneella ImmunoRatio2-ohjelmalla viidestä eniten positiivisesti värjäytyneestä alueesta. KIT-värjäyksellä saatiin varmistettua, että solut lasketaan vain kasvaimen alueelta. Alkuperäiseen lääketutkimukseen osallistui alun perin 400 potilasta. Tässä tutkimuksessa analysoitava tulos saatiin 285-330 potilaasta, määrä vaihtelee eri värjäysten välillä. Tuloksissa havaittiin, että kasvaimeen tunkeutuvien immuunijärjestelmän solujen määrä on suuri GIST:ssä. Eniten havaittiin T-lymfosyyttejä sekä makrofageja. T-lymfosyyteistä iso osa oli tappaja-T-lymfosyyttejä, mutta säätelijä-T-lymfosyyttejä havaittiin myös suhteellisen paljon. B-lymfosyyttejä esiintyi myös suhteellisen paljon. Luonnollisten tappajasolujen määrä oli vähäinen. Tulokset ovat suurelta osin linjassa aiemmin julkaistujen tulosten kanssa. Seuraavaksi tutkimuksessa saatu informaatio kasvaimeen tunkeutuvista immuunijärjestelmän soluista yhdistetään alkuperäisen SSG:n lääketutkimuksen tuottamaan informaatioon. Tämän jälkeen analysoidaan kasvaimeen tunkeutuvien immuunijärjestelmän solujen tyypin ja määrän assosiaatio GIST potilaan taudin kehittymiseen ja ennusteen. Lopulliset tulokset julkaistaan tieteellisen artikkelin muodossa.