Phenotyping Fusarium head blight resistance in oats having low deoxynivalenol content

Show simple item record

dc.contributor Helsingin yliopisto, maatalous-metsätieteellinen tiedekunta fi
dc.contributor Helsingfors universitet, agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten sv
dc.contributor University of Helsinki, Faculty of Agriculture and Forestry en
dc.contributor Uusiutuvien luonnonvarojen kestävän käytön tohtoriohjelma fi
dc.contributor Doktorandprogrammet i hållbart utnyttjande av förnybara naturresurser sv
dc.contributor Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources en
dc.contributor Luonnonvarakeskus en
dc.contributor.author Hautsalo, Juho
dc.date.accessioned 2020-07-28T06:52:44Z
dc.date.available 2020-09-01
dc.date.available 2020-07-28T06:52:44Z
dc.date.issued 2020-09-11
dc.identifier.uri URN:ISBN:978-951-51-6255-7
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10138/317969
dc.description.abstract Fusarium head blight (FHB) disease and the mycotoxins produced by its causal agents such as Fusarium graminearum Schwabe, F. culmorum (Wg. G. Sm.) and F. langsethiae Torp and Nirenberg have become a growing problem for oat (Avena sativa L.) production in the northern countries over the last decades. Since Nordic oats and oat products are branded as high quality and healthy food, FHB has to be managed. Controlling FHB by agricultural or manufacturing practices can be a cumbersome task. Therefore development of resistant cultivars would offer a highly needed and economical solution to the problem. The primary aim of this thesis was to improve the tools for FHB resistance breeding in oats. Resistance among genebank accessions and Nordic oat breeding material, inoculation methods and potential traits to measure resistance were evaluated in several field and greenhouse experiments in Finland. The results obtained from the field experiments had more practical relevance than greenhouse experiments in identification of cultivars that accumulate less DON. In the field conditions, the escape mechanisms such as early flowering, height or high rate of anther extrusion through open flowering can all affect to DON accumulation and Fusarium infection within an oat plant. Large variation in several Fusarium-associated traits among the breeding material indicates that FHB resistance in Finnish oats can be improved. However, the results also underline that there are several components of resistance that need to be considered, since the estimates for DON accumulation, germination capacity and proportion of Fusarium infected kernels did not give similar rankings for all of the genotypes. Further research is recommended in order to gain better understand the genetics of FHB resistance in oats. In addition, more efficient methods for the phenotyping of large progenies are needed. In future breeding, the amount of phenotyping can be reduced when readiness for genomic selection is on place. Also other Fusarium species and mycotoxins need to be considered in future resistance studies. en
dc.description.abstract Punahomeet (Fusarium-sienet) ja niiden tuottamat terveydelle haitalliset homemyrkyt, mykotoksiinit, uhkaavat kauran elintarvikekäyttöä ja aiheuttavat merkittäviä tappioita maanviljelijöille. 2000-luvulla etenkin deoksinivalenoli-toksiinia (DON) tuottavat punahomeet ovat yleistyneet Pohjois-Euroopan ja myös Suomen viljapelloilla, ja vakavina tartuntavuosina EU:n DON-toksiinille asettama elintarvikekäytön hylkäysraja ylittyy kymmenillä prosenteilla kauranäytteistä. Toksiinien riskiä voidaan pienentää kaurassa esimerkiksi peittauksella, viljelykierrolla tai sadon lajittelun ja kuorinnan avulla. Silti, vaikka viljelijä tekisi kaiken oppikirjan mukaan, voivat raja-arvot ylittyä. Taudinkestävät lajikkeet toisivat kaivattua lisäapua taudinhallintaan. Tässä väitöskirjatyössä selvitettiin yhteistyössä Boreal Kasvinjalostus Oy:n kanssa, miten kasvinjalostaja voi arvioida kauran jalostuslinjan punahomekestävyyttä tartutetuissa kenttä- ja kasvihuonekokeissa ja millaista taudinkestävyyttä kaurasta voi löytyä. Sadoista jalostuslinjoista sekä kymmenistä pohjoismaisista lajikkeista ja kirjallisuuden perusteella lupaavaksi osoittautuneista geenipankkikauroista mitattiin DON–toksiinipitoisuuksia, itävyyttä ja punahometartunnan saaneiden jyvien määrää. Lisäksi vertailtiin erilaisia tartutus- ja tartunnan mittausmenetelmiä ja selvitettiin kauran kukintaominaisuuksien sekä hometoksiinien yhteyttä. Keinotekoisesti tartutettujen kenttäkokeiden avulla saadaan luotettavin kuva kauralajikkeiden punahomekestävyydestä ja pystytään karsimaan selvästi alttiimpia kauroja. Tulokset kannustavat parantamaan punahomekestävyyttä ensisijaisesti jalostusaineistoa hyödyntäen. Toksiinipitoisuuksien ja kauran kukinnan avoimuuden väliltä löytyi selvä yhteys, mutta myös esimerkiksi kauran kehitysnopeus ja pituuskasvu vaikuttivat toksiinipitoisuuksiin. Kauran punahometartuntaa mittaavista suureista DON-pitoisuus on tärkein, mutta myös itävyys ja tartunnan saaneiden jyvien määrä mahdollistavat lajikkeiden vertailun. Useaa suuretta yhdessä tarkasteltaessa voidaankin erottaa toisiaan täydentäviä kestävyystekijöitä kauroista. Punahomeenkestävyysjalostuksessa tulee jatkossa panostaa menetelmiin, joiden avulla jokaista kauralinjaa ei tarvitsisi erikseen arvioida useiden kenttäkokeiden pohjalta (geneettiset työkalut), ja arviot tulisi pystyä tekemään toksiinimittauksia kustannustehokkaammin esim. kuvantamisteknologioita hyödyntäen. Myös muiden, kuin DON-toksiinia tuottavien punahomelajien tutkimusta tarvitaan. fi
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso en
dc.publisher Helsingin yliopisto fi
dc.publisher Helsingfors universitet sv
dc.publisher University of Helsinki en
dc.relation.isformatof URN:ISBN:978-951-51-6254-0
dc.relation.isformatof Unigrafia: dissertationes schola doctoralis scientiae circumiectalis, alimentariae, biologicae. universitatis helsinkiensis. 2342-5423
dc.relation.ispartof dissertationes schola doctoralis scientiae circumiectalis, alimentariae, biologicae. universitatis helsinkiensis
dc.relation.ispartof URN:ISSN:2342-5431
dc.rights Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty. fi
dc.rights This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited. en
dc.rights Publikationen är skyddad av upphovsrätten. Den får läsas och skrivas ut för personligt bruk. Användning i kommersiellt syfte är förbjuden. sv
dc.subject kasvipatologia
dc.title Phenotyping Fusarium head blight resistance in oats having low deoxynivalenol content en
dc.type.ontasot Väitöskirja (artikkeli) fi
dc.type.ontasot Doctoral dissertation (article-based) en
dc.type.ontasot Doktorsavhandling (sammanläggning) sv
dc.ths Jalli, Marja
dc.ths Veteläinen, Merja
dc.ths Hannukkala, Asko
dc.opn Bjørnstad, Åsmund
dc.type.dcmitype Text

Files in this item

Total number of downloads: Loading...

Files Size Format View
PHENOTYP.pdf 1.525Mb PDF View/Open

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record