Yliopiston etusivulle Suomeksi På svenska In English Helsingin yliopisto

Mass-spectrometric analysis of glycerophospholipid metabolism

Show simple item record

dc.contributor Helsingin yliopisto, bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta, biotieteiden laitos fi
dc.contributor Helsingfors universitet, bio- och miljövetenskapliga fakulteten, biovetenskapliga institutionen sv
dc.contributor University of Helsinki, Faculty of Biological and Environmental Sciences, Department of Biosciences, Biochemistry en
dc.contributor University of Helsinki, Institute of Biomedicine en
dc.contributor.author Hermansson, Martin fi
dc.date.accessioned 2012-10-09T08:51:02Z
dc.date.available 2012-10-23 fi
dc.date.available 2012-10-09T08:51:02Z
dc.date.issued 2012-11-02 fi
dc.identifier.uri URN:ISBN:978-952-10-8339-6 fi
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10138/37154
dc.description.abstract This thesis consists of five parts. In the first part, the first automated method for quantitative analysis of lipid compositions of cells and tissues by liquid chromatography-mass spectrometry was developed. In the second part, this method was applied to investigate brain lipid compositions of patients with progressive epilepsy with mental retardation (EPMR), caused by mutations in the CLN8 gene. We were able to show major progressive alterations in brain lipid profiles of EPMR patients which may contribute to disease pathogenesis in those patients. In the third part, a novel approach to investigate the metabolism of single glycerophospholipid molecular species in living cells was developed. This approach was applied to study mechanisms of acyl chain remodeling, i.e. the exchange of fatty acyl residues, of aminophospholipids in BHK and HeLa cells. In the fourth part a novel mass-spectrometric approach was developed to investigate the substrate specificity of phospholipases and was utilized to elucidate the specificities of secretory A-type phospholipases in unprecedented detail. We showed that the specificity of those phospholipases depended mainly on the propensity of the substrates to efflux from the membrane and interactions between the substrate and the enzyme catalytic site are secondary. In the fifth part of this thesis, mechanisms of mammalian glycerophospholipid homeostasis were reviewed and novel theoretical considerations presented. en
dc.description.abstract Tämä väitöskirjatyö koostuu viidestä osasta. Ensimmäisessä osatyössä kehitimme ensimmäisen automatisoidun nestekromatografia-massaspektrometriaan perustuvan menetelmän solujen ja kudosten lipidikoostumusten määrittämiseen. Toisessa osatyössä hyödynsimme em. menetelmää tarkastellaksemme lipidikoostumuksia ns. pohjoista epilepsiaa (EPMR) sairastavien potilaiden aivoista. Osoitimme, että potilasaivojen lipidikoostumuksessa tapahtuu progressiivisia muutoksia, jotka saattavat vaikuttaa taudin patogeneesiin. Kolmannessa osassa kehitimme uuden lähestymistavan yksittäisten fosfolipidimolekyylien aineenvaihdunnan tutkimiseen elävissä soluissa. Tätä menetelmää hyödyntäen tutkimme fosfolipidien rasvahappoketjujen muokkauksen mekanismeja BHK ja HeLa soluissa. Neljännessä osatyössä kehitettiin massaspektrometriaan perustuva menetelmä fosfolipaasien substraattispesifisyyden tutkimiseen. Em. menetelmää hyödyntäen määritimme kolmen ns. sekretorisen A-tyypin fosfolipaasin substraattispesifisyyden ennennäkemättömällä tarkkuudella. Osoitimme, että näiden fosfolipaasien substraattispesifisyyden määrää pääosin substraattien taipumus irtautua kalvosta ja substraatin ja katalyyttisen keskuksen väliset vuorovaikutukset ovat toissijaisia. Väitöskirjatyön viides osa on katsaus-tyyppinen tarkastelu glyserofosfolipidihomeostaasin mekanismeista, jossa esitetään myös uusia teoreettisia pohdintoja. fi
dc.format.mimetype application/pdf fi
dc.language.iso en fi
dc.publisher Helsingin yliopisto fi
dc.publisher Helsingfors universitet sv
dc.publisher University of Helsinki en
dc.relation.isformatof URN:ISBN:978-952-10-8338-9 fi
dc.rights Julkaisu on tekijänoikeussäännösten alainen. Teosta voi lukea ja tulostaa henkilökohtaista käyttöä varten. Käyttö kaupallisiin tarkoituksiin on kielletty. fi
dc.rights This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited. en
dc.rights Publikationen är skyddad av upphovsrätten. Den får läsas och skrivas ut för personligt bruk. Användning i kommersiellt syfte är förbjuden. sv
dc.subject biokemia fi
dc.title Mass-spectrometric analysis of glycerophospholipid metabolism en
dc.type.ontasot Väitöskirja (artikkeli) fi
dc.type.ontasot Doctoral dissertation (article-based) en
dc.type.ontasot Doktorsavhandling (sammanläggning) sv
dc.ths Somerharju, Pentti fi
dc.opn Ejsing, Christer fi
dc.type.dcmitype Text fi

Files in this item

Files Description Size Format View/Open
massspec.pdf 558.7Kb PDF View/Open
This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search Helda


Advanced Search

Browse

My Account