TY  -  
T1  - Developing probabilistic restraints optimization protocols to extend MODELLER capabilities 
SN  -  /  
UR  - URN:NBN:fi:hulib-201810303462; http://hdl.handle.net/10138/277662 
T3  -  
A1  - Grazhdankin, Evgeni 
A2  -  
PB  - Helsingfors universitet 
Y1  - 2018 
LA  - eng 
AB  - Kehitimme ohjelmiston homologimallinnusta varten avaruudellisilla rajoitteilla käyttäen MODELLER-taustaohjelmistoa. Laaditut protokollat laajentavat tutkittavaa pituusrajoite- ja konformaatioavaruutta. Rajoitteita optimoidaan iteratiivisilla protokollilla, joissa mallien rakentamisessa käytettyjä rajoitteita arvioidaan ja niiden suotuisuuden todennäköisyyttä päivitetään sitä vastaten. Metriikoina hyödynnämme muun muassa DOPE-pisteytystä, sekä retrospektiivista rajoitteiden toteutumista mallissa.... 
VO  -  
IS  -  
SP  -  
OP  -  
KW  - homology; comparative; MODELLER; restraint; structure; drug design; modelling; homologia; vertaileva; MODELLER; rajoitus; rakenne; lääkekehitys; mallinnus; Farmaseuttinen kemia; Proviisorin koulutusohjelma 
N1  -   
PP  -  
ER  -