The Skin Microbiome : Investigations on skin malignancies and preterm newborn skin

Show full item record



Permalink

http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-51-3157-7
Title: The Skin Microbiome : Investigations on skin malignancies and preterm newborn skin
Author: Salava, Alexander
Contributor: University of Helsinki, Faculty of Medicine, Clinicum, Iho- ja allergiasairaala, HYKS
Publisher: Helsingin yliopisto
Date: 2018-04-06
Language: en
URI: http://urn.fi/URN:ISBN:978-951-51-3157-7
http://hdl.handle.net/10138/232567
Thesis level: Doctoral dissertation (article-based)
Abstract: The skin microbiome – Investigations on skin malignancies and preterm newborn skin Skin disorders have been associated with specific microbiome changes and raised an interest in developing new diagnostic methods and treatments. Our object was to investigate the microbiome in skin cancer (melanoma) and inflammatory skin disorders (parapsoriasis) and to explore the skin microbiome in very low birth weight infants in intensive care and possible association to neonatal sepsis. Microbiome samples were taken of 15 cutaneous melanomas and 17 benign melanocytic nevi, of 13 patients with parapsoriasis and 12 very low birth weight infants during treatment in intensive care. Sequencing was carried out on 454 GS-FLX Titanium and Illumina MiSeq platforms and the data was analyzed by bioinformatics. There were no significant differences in the microbiome of melanomas, melanocytic nevi and controls. Additionally, the microbiome showed no significant differences between parapsoriasis and the same patient’s healthy skin. We observed a high cutaneous microbial diversity in most of the infants at birth and there was a decrease in diversity during the first three weeks of life. There was no association between microbiome changes and neonatal sepsis. The results suggest that microbiome swab sampling may not be helpful in diagnostics of melanoma or parapsoriasis. Moreover, microbiome changes seem not to play a role in parapsoriasis. We could demonstrate that very low birth weight infants in intensive care have a high cutaneous microbial diversity during the first days of life regardless of the way of delivery, prematurity causes or perinatal infections. The diversity decreases during the first weeks of life possibly due to intensive care treatment and antibiotics. Neonatal sepsis is not linked to microbiome changes and it is likely that other factors play a role, e.g. skin injury by medical devices and concomitant infections.Ihon mikrobiomi - tutkimuksia ihosyövissä ja vastasyntyneiden keskosten ihossa Väitöskirjassa tutkittiin ihon mikrobiomia uusilla molekyyligenetiikkaan pohjautuvilla tutkimusmenetelmillä, jotka ovat herättäneet kiinnostusta diagnoosimenetelmien ja hoitomuotojen löytämiseksi. Tavoitteena oli selvittää mikrobiomi ihosyövässä (melanooma) ja tulehduksellisissa ihosairauksissa (parapsoriasis) sekä kartoittaa mikrobiomi erittäin alhaisen syntymäpainon keskosissa tehohoidossa ja sen mahdollista yhteyttä verenmyrkytykseen. Mikrobiominäytteitä otettiin 15 melanoomasta ja 17 hyvänlaatuisesta melanosyyttiluomesta, 13 parapsoriasis potilaasta ja 12 erittäin alhaisen syntymäpainon keskosesta tehohoidon aikana. Analysointi toteutettiin molekyyligenetiikkaan pohjautuvilla sekvensointimenetelmillä. Merkittäviä eroja mikrobiomissa tai bakteeriston diversiteetissä ei tullut esille melanoomien ja hyvänlaatuisten luomien välillä. Ihon mikrobiomissa ei myöskään todettu merkittäviä eroja parapsoriasis ihottuman ja terveen näköisen ihon välillä. Useimmilla keskosilla havaittiin syntyessä korkea ihon bakteeriston monimuotoisuus (diversiteetti). Kolmen ensimmäisen elinviikon aikana diversiteetti kaventui, mutta tämä ei ollut ajallisessa yhteydessä verenmyrkytykseen. Löydöksemme viittaavat siihen, että mikrobiomin tutkimisesta ei ole hyötyä melanooman diagnostiikassa. Emme myöskään havainneet viitteitä siitä, että mikrobiomin muutoksilla tai stafylokokkibakteereilla olisi merkitystä parapsoriasiksessa. Pystyimme osoittamaan mikrobiomin korkean diversiteetin keskosten ensimmäisinä elinpäivinä riippumatta syntymistavasta, keskosuuden syystä tai infektioista. Vastasyntyneiden verenmyrkytys ei ollut yhteydessä mikrobiomin muuttumiseen ja tämän taustalla on luultavasti muita tekijöitä kuten ihoa lävistävät lääkinnälliset laitteet tehohoidossa tai samanaikaiset infektiot.
Subject:
Rights: This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.


Files in this item

Total number of downloads: Loading...

Files Size Format View
THESKINM.pdf 976.1Kb PDF View/Open

This item appears in the following Collection(s)

Show full item record